Το Τμήμα Μαθηματικών ιδρύθηκε το 1966 με το Β.Δ. 223/1966 (Φ.Ε.Κ. 58/Α/14.03.1966) και είναι το δεύτερο σε σειρά αρχαιότητας Τμήμα του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων. Στην 50-ετή και πλέον εξελικτική του πορεία, το Τμήμα Μαθηματικών πέρασε από διάφορα στάδια ανάπτυξης. Σήμερα, διαδραματίζει ένα σημαντικό ρόλο στο επιστημονικό γίγνεσθαι όχι μόνο της περιοχής των Ιωαννίνων και της Ηπείρου, αλλά της χώρας, γενικότερα. Το ερευνητικό του έργο και η ερευνητική του παρουσία αναγνωρίζεται διεθνώς. Το Πρόγραμμα Σπουδών του – τόσο στον προπτυχιακό, όσο και τον μεταπτυχιακό κύκλο – χαρακτηρίζεται από πλουραλισμό και θεραπεύει όλους τους σύγχρονους κλάδους της μαθηματικής επιστήμης.

Το Τμήμα απαρτίζεται οργανωτικά από 4 Τομείς (Φ.Ε.Κ. 149/Β/06.04.1983 και Φ.Ε.Κ. 2418/Β/07.06.2021):

• Μαθηματικής Ανάλυσης
• Άλγεβρας και Γεωμετρίας
• Πιθανοτήτων, Στατιστικής και Επιχειρησιακής Έρευνας
• Εφαρμοσμένων και Υπολογιστικών Μαθηματικών